Webサービス脆弱性検査ツール

Acunetix Web Vulnerability Scanner という有償製品が比較的高機能で使いやすそうです。
Hotscriptsから、フォーム入力なしでトライアル版がダウンロードできます。
 
トライアルは検査対象サイトが、Acunetix のテスト用サイトに限定されてしまうため、性能については試せませんが、使い勝手等は体感できます。